Здесь описаны два способа сброса пароля для Битрикс Управление сайтом и Корпоративный портал.

Для Управления сайтом

1. Через запрос к базе

UPDATE `b_user` SET password= MD5('123456') where login = "admin"

2. Через php

Создаем файл заливаем в корень сайта и переходим на него. Файл со следующим содержанием

<?
require($_SERVER['DOCUMENT_ROOT']."/bitrix/header.php");
echo $USER->Update(1,array("PASSWORD"=>'123456'));
echo $USER->LAST_ERROR;
require($_SERVER['DOCUMENT_ROOT']."/bitrix/footer.php");
?>

Для Корпоративного портала сработает только запрос к базе данных (если закрыт доступ к публичной части)

UPDATE `b_user` SET password= MD5('123456') where login = "admin"