Например у вас стоит битрикс виртуальная машина и вы скопировали файлы сайта по sftp, соответственно владелец этих файлов будет root и доступа сайта к этим файлам не будет, чтобы автоматически сменить владельца у всех папок и файлов необходимо в ssh консоли выполнить следующую команду
chown -R bitrix:bitrix /home/bitrix/www/
если веб ресурс находится на дополнительном домене
chown -R bitrix:bitrix /home/bitrix/ext_www/1c8.pl.ua/